Ключ. слова: астроцитома, експресiя генiв, пухлиннi маркери
Індекс рубрикатора НБУВ: Р569.627

Рубрики:

Пухлини центральної нервової системи

Шифр НБУВ: Ж14160 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Проаналізовано експресію генів основного білка мієліну (MBP, myelin basic protein) і гліального фібрилярного кислого білка (GFAP, glial fibrillary асуdic protein) у гліальних пухлинах головного мозку людини для визначення специфічності експресії цих генів залежно від типу пухлин і ступеня їх злоякісності. За результатами аналізу з використанням Нозерн-блот гібридизації виявлено низький вміст мРНК MBP у зразках астроцитарних гліом II - IV ступенів злоякісності та набагато вищий вміст у прилеглій до них перифокальній зоні, яка виказує гістологічні ознаки нормального головного мозку. Переважна частина дифузних астроцитом та анапластичних астроцитом характеризується низьким рівнем експресії гена MBP і високим рівнем експресії гена GFAP, але є можливим виділення окремого підтипу дифузних та анапластичних астроцитом із високим рівнем експресії гена MBP, що може бути відображенням різних молекулярних шляхів виникнення астроцитом. Дуже низький вміст або відсутність мРНК MBP виявлено в олігодендрогліомі та в усіх олігоастроцитомах. Дані Нозерн-гібридизації корелюють із серійним аналізом генної експресії. Одержані результати свідчать про те, що MBP не є специфічним молекулярним маркером пухлин олігодендрогліального походження, але дослідження відносних рівнів мРНК MBP і GFAP може бути корисним для розпізнавання гліальних пухлин і ці два гени разом із дослідженими раніше YKL-40 і TSC-22 можуть бути включені до панелі генів для визначення так званих "генних підписів (сигнатур)" пухлин головного мозку. Однак суворі вимоги щодо клінічного значення цих "генних

сигнатур" не можна сформулювати без їх перевірки на великій кількості клінічних зразків.

Значну частину супресорних генів астроцитарних пухлин до ціх не ідентифіковано, незважаючи на те, що докази їх існування на різних хромосомах людини підтверджені останніми роками численними дослідженнями. Тому пошук нових генів, активація або інактивація яких асоційована з прогресією гліальних пухлин, є метою інтенсивних досліджень. У даній роботі диференційна гібридизація "грид" упорядкованих бібліотек кДНК ембріонального і постнатального головного мозку людини показала різницю в рівні сигналу з пробами тотальної кДНК нормального головного мозгу і мультиформної гліобластоми для більш ніж сотні клонів кДНК. Повторна диференційна гібридизація відібраних первинним скринінгом клонів, а також аналіз РНК зразків нормального головного мозку і гліальних пухлин дозволили виявити 16 нуклеотидних послідовностей, вміст яких змінюється в пухлинах. Серед мРНК, вміст яких зменшується в астроцитарних пухлинах, ідентифіковано мРНК TSC-22, відповідна кДНК якої міститься в клоні ICRFp507J1041 бібліотеки кДНК ембріонального головного мозку людини. Нозерн-гібридизація тотальних РНК чотирьох зразків нормального головного мозку та 17 зразків різних пухлин головного мозку виявила значне зменшення експресії гена TSC-22 в більшості зразків мультиформної гліобластоми, анапластичної астроцитоми, астроцитоми II ступеня злоякісності, а також у деяких інших новоутвореннях - загалом, в 12 індивідуальних пухлинах. У декількох пухлинах головного мозку експресія гена TSC-22 була відсутня повністю. Саузерн-гібридизація геномної ДНК виявила делеції в геномному локусі гена TSC-22 у двох з трьох досліджених зразків анапластичних астроцитом. Показаний

у даній роботі суттєво зменшений рівень продукції мРНК TSC-22 в пухлинах головного мозку, описаний раніше зменшений вміст мРНК TSC-22 в пухлинах слинної залози, делеції в локусі гена TSC-22 в анапластичних астроцитомах, негативна роль білка TSC-22 в процесі проліферації клітин, локалізація гена TSC-22 на ділянці 13g14 поряд з геном ретинобластоми (Rb) - все це свідчить про потенційну супресорну роль зазначеного гена.

Індекс рубрикатора НБУВ: Р569.627.7-29

Рубрики:

Пухлини головного мозку та його оболонок

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Р569.627.7 + Е60*739.177*44

Рубрики:

Пухлини головного мозку та його оболонок

Загальна зоологія

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е60*669.53*443.1 + Р569.627.7-29

Рубрики:

Загальна зоологія

Пухлини головного мозку та його оболонок

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Публічну базу даних із серійного аналізу генної експресії (SAGE) використано для ідентифікації потенційних молекулярних маркерів астроцитарних гліом людини. У ході порівняння дев'яти SAGE-бібліотек гліобластом, 11 SAGE-бібліотек анапластичних астроцитом, восьми SAGE-бібліотек дифузних астроцитом і п'яти SAGE-бібліотек нормального головного мозку виявлено 57 генів, рівень експресії яких був більш ніж у 5 разів вищим ($E p~symbol Г~0,05>) в астроцитарних гліомах відносно нормального головного мозку. Серед змін експресії генів, які відбуваються на ранньому етапі формування астроцитом та виявляються і на наступних етапах їх розвитку, деякі модифікації є характерними лише для високозлоякісних стадій розвитку пухлин і відсутні в пухлинах низького ступеня злоякісності. Результати аналізу експресії виявлених генів можна використовувати для молекулярної класифікації гліальних пухлин, діагностики, прогностичної оцінки пухлин і визначення потенційних мішеней протипухлинної терапії.

У результаті порівняння профілів експресії генів у нормальному головному мозку та гліобластомі з використанням бази даних серійного аналізу генної експресії (Serial Analysis of Gene Expression, SAGE) виявлено 129 генів з більш ніж п'ятиразовою зміною рівня експресії у гліобластомі, з яких 85 генів - зі зниженою експресією. У дифузній та анапластичній астроцитомах кількість генів зі зниженою в п'ять разів експресією є меншою. Лише для дев'яти генів п'ятиразове зниження експресії відбувається в дифузних астроцитомах і виявляється приблизно на такому ж рівні в анапластичних астроцитомах і в гліобластомах. Для переважної більшості інактивованих генів рівень експресії знижується в дифузних астроцитомах і послідовно зменшується на подальших стадіях злоякісної прогресії астроцитом, причому в гліобластомах - найзлоякіснішому прояві гліальних пухлин - експресія деяких генів є дуже низькою або зовсім відсутньою. Нозерн-гібридизація та зворотна транскрипція - полімеразна ланцюгова реакція - підтвердили знижену експресію в гліобластомах довільно відібраних генів. Деякі гени можуть кодувати пухлинні супресори і їх знижена експресія, очевидно, відіграє важливу роль в ініціації та прогресії гліом людини.

Індекс рубрикатора НБУВ: Р569.627.7

Рубрики:

Пухлини головного мозку та його оболонок

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

За порівняння профілів експресії генів у різних типах пухлин і нормальному головному мозку людини за допомогою серійного аналізу генної експресії (SAGE) виявлено надзвичайно високий вміст "ярлика" CTTGGGTTTT в SAGE-бібліотеках менінгіом і епендімом. Пошук відповідного гена для цього "ярлика" на веб-сторінці "SAGE Anatomic Viewer" показав, що він належить нуклеотидній послідовності гена інсуліноподібного фактора росту II (IGF-II), а також відкритої межі зчитування 43 на хромосомі 11 (C11orf43). Ця нуклеотидна послідовність кодує потенційний білок, асоційований з IGF-II (IGF-IIA), мРНК для якого утворюється внаслідок процесингу первинного транскрипта гена IGF-II. Нозерн-блот аналіз гліальних пухлин і менінгіом показав надзвичайно високий рівень продукції цієї мРНК в менінгіомах. Кодований нею білок може відігравати важливу роль у формуванні менінгіом і бути їх специфічним молекулярним маркером.